L’ENSMG est dirigée par un directeur assisté d’un directeur des études.
Elle est administrèe par un conseil d'établissement qui comprend: 
le Recteur; les représentants des ministéres de l'Enseignement supérieur, chargé des Finances, chargé des Mines et/ou de la Géologie, chargé du Pétrole, le représentant du Ministre chargé de l’Industrie, chargé de l’Environnement, chargé de l’Eau ; le Directeur de l’ENSMG ; le Directeur des études de l’ENSMG ; les Chefs de départements élus ou désignés par le département ;le Chef des Services Administratifs ;le Directeur du Centre des Œuvres Universitaire ; des représentants élus ou désignés par le personnel administratif, technique et de service selon les modalités prévues par arrêté rectoral ; des personnes extérieures choisies en raison des professions ou activités qu’elles exercent ou qui les rapprochent de celles auxquelles préparent les études à l’Ecole; les représentants des élèves élus; un représentant des anciens élèves élus; les enseignants-chercheurs de l'école.